На відміну від червоного і пантерного мухомора в королівському мухоморі немає навіть невеликої дози мускарину. До його складу входить лише мусцимол та іботенова кислота.
Королівський мухомор часто плутають із червоним та пантерним мухоморами, оскільки вони зовні знаходяться приблизно між цими видами. Однак якщо уважно придивитися, то королівський мухомор легко відрізнити від червоного мухомора тим, що його капелюшок навіть не має натяку на червоний відтінок. У його забарвленні є виключно жовті, білі та коричневі кольори. Крім того, у королівського мухомора на ніжці є жовті пластівці, чого немає у червоного мухомора.
Іноді королівські мухомори виростають блідо забарвленими, при цьому капелюшок невиразного жовто-коричневого кольору, у цьому випадку його можна переплутати з сіро-рожевим мухомором. Але останній легко розпізнати по м'якоті, що червоніє на зрізі.
По фарбуванню з королівським мухомором схожий пантерний мухомор, але його можна відрізнити по білій, а не жовтій м'якоті під шкіркою капелюшка, крім цього, в основі ніжки знаходиться вольва чашкоподібної форми, вона не приросла, як у королівського мухомора, а з яскраво вираженим краєм, що відстає.